A APAE – Associação de Pais e Amigos dos Excepcionais de São Roque, foi fundada em 24 de setembro de 1981, por um grupo de voluntários, com o objetivo de atender pessoas com deficiências do município de São Roque e região. É uma associação civil, filantrópica, de caráter cultural, educacional e assistencial que atua nos setores de educação, trabalho e saúde, tendo como missão promover e articular na defesa de garantia dos direitos, na prevenção, orientação e prestação de serviços de apoio às famílias, visando à melhoria na qualidade de vida das mesmas, colaborando assim, para a construção de uma sociedade justa, solidária e igualitária, principalmente por meio da inclusão educacional e inserção social.
A Instituição está preparada para ofertar seus serviços através dos diversos Programas existentes. Possuem atualmente em sua unidade 193 assistidos atendidos nos diferenciados Programas: Avaliação, Estimulação Precoce, Atendimento Ambulatorial Especializado (Programa A.A.E), Ensino Fundamental, Centro de Convivência (Oficina terapêutica, Grupo Terapêutico, Capoeira Especial, Lazer, Culinária, Salão de Beleza, Música (em andamento) e Clube de Mães.